RBMO 55(1): 85-89
|
|
Development of six novel microsatellite markers for the Chilean red alga Pyropia orbicularis |
|
Gabriel Pérez-Lara1,2, Andrés Meynard1,2,3, Paula Alvear1, Cristian Bulboa-Contador1,2 and Loretto Contreras-Porcia1,2,3* |
|
1Departamento de Ecología y Biodiversidad, Facultad de Ciencias de la Vida, Universidad Andres Bello, República 440, Santiago, Chile |
|
El 27 de febrero de 2010, la zona centro-sur de Chile (ca., 34-39°S) fue afectada por un terremoto de magnitud Mw= 8,8, localizándose el epicentro en Cobquecura (ca., 36°S), causando un levantamiento continental en las costas más cercanas a la fosa (i.e., Península de Arauco e Isla Santa María) y subsidencia en áreas costeras localizadas al norte de esas costas (Región del Maule). En este estudio se evaluó la hipótesis de que independientemente del grupo taxonómico, los organismos bentónicos intermareales adheridos al sustrato pueden ser utilizados como indicadores de levantamiento cosísmico continental. La metodología consistió en medir la altura del límite superior de las bandas de distribución de cada especie sobre el nivel de marea baja, a lo largo de la costa afectada por el terremoto. El alga calcárea Lithothamnium sp., el mitílido Perumytilus purpuratus y las macroalgas Mazzaella laminarioides y Lessonia spicata, son organismos bentónicos apropiados para describir el levantamiento continental cosísmico. Se sugiere que en estudios tendientes a evaluar este tipo de procesos tectónicos, se utilice más de una especie para tener una visión completa de tal proceso a lo largo de gradientes de deformación continental. Esto ya que, parte importante de las especies bentónicas de la costa rocosa no tienen distribución continúa, por lo que el uso de una sola especie puede resultar en conclusiones con bajo nivel de generalización.
Palabras clave: Levantamiento continental, organismos bentónicos, subsidencia
Mariculture of edible Porphyra/Pyropia species, which are cosmopolitan red foliose algae, represent an important source of income for the pharmaceutical and food industries. In Chile, the most common alga of this complex is Pyropia orbicularis (Bangiales, Rhodophyta). Here we report 6 microsatellite markers obtained from P. orbicularis through a genomic library from 10 individuals of the gametophytic phase by next generation (Illumina) sequencing. Polymorphism analyses were done from 10 individuals of the conchocelis phase, revealing an allelic diversity ranging from three to six alleles per locus, and observed heterozygosity (HO) and expected heterozygosity (HE) ranging from 0.200 to 0.995, and 0.250 to 0.610, respectively. A large proportion of genetic variance (61%) in P. orbicularis was among individuals within population, and 39% genetic variance was among populations. Nonetheless, these results should be interpreted with caution; further research using larger sample sizes is required. These polymorphic markers could be useful in future studies on population genetic structure, for conservation and applied purposes. |
|
Key words: Pyropia orbicularis, microsatellite markers, Rhodophyta |
|