Volumen 43 - Número 3: 547-557 | 2008
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Caracterización molecular de las comunidades bacterianas asociadas a sedimentos de un sistema costero del norte de la corriente de Humboldt, bahía de Mejillones del Sur, Chile

Rubén Araya^1,2*, Juan C. Leiva³ y Jorge Valdés⁴

¹Instituto de Recursos Naturales Renovables (IA-RnR), Universidad de Antofagasta, Avda. Angamos 601, Antofagasta Chile
²Departamento de Acuicultura, Universidad de Antofagasta, Avda. Angamos 601, Antofagasta Chile
³Programa Doctorado en Ciencias Aplicadas Mención SMC, Universidad de Antofagasta, Avda. Angamos 601, Antofagasta, Chile
⁴Instituto de Investigaciones Oceanológicas, Universidad de Antofagasta, Avda. Angamos 601, Antofagasta, Chile

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Para conocer la estructura de comunidades bacterianas asociadas a sedimentos marinos del sistema costero de la corriente de Humboldt en la bahía de Mejillones del Sur (23ºS), Chile, se realizaron análisis de electroforesis en gel de gradiente desnaturalizante (DGGE) a partir de fragmentos del 16S rADN para el Dominio Bacteria, junto con el análisis de escala multidimensional (MDS). Para esto, se realizaron muestreos de sedimentos en cuatro sectores dentro de la bahía de Mejillones del Sur, durante tres períodos de muestreo y cuatro profundidades. El análisis genético de las comunidades procarióticas estudiadas reveló una alta diversidad bacteriana, la cual se estableció por el gran número de bandas detectadas por DGGE. El análisis de MDS evidenció cambios en la estructura de las comunidades asociadas a los sedimentos recolectados a 10 m, entre las 4 estaciones de muestreo. Se encontraron además, diferencias en la estructura de comunidades procarióticas asociadas a las distintas profundidades analizadas. Esta variación en la estructura genética de las comunidades procarióticas estuvo influenciada por cambios en los patrones de circulación al interior de la bahía, los cuales se asociarían al efecto de los focos de surgencia que ingresan por el margen noreste de la bahía. En conclusión, la técnica de DGGE nos permitió establecer cambios en la estructura de las comunidades bacterianas a través del análisis cualitativo de muestras obtenidas en los diferentes sectores y tiempos de muestreo.

Palabras clave: DGGE, MDS, bacteria