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NÚMERO 1

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The effect of protein and lipid level on the specific dynamic action and post-prandial nitrogen excretion in subadult of white shrimp Litopenaeus vannamei

Análisis bioinformático del sistema flagelar de la alphaproteobacteria tipo rickettsia Candidatus Hepatobacter penaei

Autores

CORRESPONSAL

Teresa Gollas-Galván

tgollas@ciad.mx

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Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C, Carretera a La Victoria, km. 0.6, C.P. 83304, Hermosillo, Sonora, México

Juan Manuel Leyva

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Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C, Carretera a La Victoria, km. 0.6, C.P. 83304, Hermosillo, Sonora, México

Marcel Martínez-Porchas

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Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C, Carretera a La Victoria, km. 0.6, C.P. 83304, Hermosillo, Sonora, México

Francisco Vargas-Albores

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Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C, Carretera a La Victoria, km. 0.6, C.P. 83304, Hermosillo, Sonora, México

Jorge Hernández-López

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Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C., Hermosa 101, Col. Los Ángeles, CP. 83106, Hermosillo, Sonora, México

Resumen

La presencia de sistemas flagelares es común en muchas bacterias de vida libre, sin embargo, estos han sido considerados ausentes en bacterias del orden Rickettsiales. Candidatus Hepatobacter penaei es una bacteria Rickettsial de origen marino descrita como un microorganismo con motilidad, propulsada por un sistema flagelar, el cual también facilita la infección. Siendo esta bacteria uno de los principales riesgos de infección en granjas camaronícolas. El objetivo de este trabajo fue determinar la presencia de genes que codifiquen proteínas del sistema flagelar de la bacteria Candidatus Hepatobacter penaei. Para el análisis se utilizó la secuencia genómica la base de datos del GenBank con número de acceso NZ_JQAJ00000000.1, una vez detectados los genes, se dedujeron las secuencias de aminoácidos. Las secuencias de aminoácidos del sistema flagelar se identificaron mediante BlastP, por medio de un alineamiento múltiple de dominios conservados. Posteriormente, se realizó un modelado de la proteína FlhA y se comparó con la proteína reportada para Oceanibaculum indicum para la conformación hojas b y a hélices. Los resultados mostraron la presencia de algunas secuencias de aminoácidos relacionadas con los genes del sistema flagelar de la bacteria como MotA, FliG, FliN, FliL FlhA, FlhB, FliQ, FliR y FliF. Finalmente, estos resultados sugieren que Candidatus Hepatobacter penaei es una bacteria tipo Rickettsia que posee un sistema flagelar, el cual posiblemente le confiere motilidad y forma parte del proceso de infección en hospederos como crustáceos marinos.

Palabras clave

NHPB, flagelo, camarón, bacteria intracelular, patógenos marinos

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